Isabelle Maroger est née d'une mère norvégienne et d'un père français. Elle a fait ses études à l’école Émile-Cohl de Lyon, ville où elle vit toujours et dans laquelle elle fait partie de l'atelier Le Bocal. Depuis 2003, elle a illustré plus de deux cent ouvrages.

En 2021, elle réalise une bande dessinée pour Oxfam France sur la vaccination comme enjeu mondial.

En 2024, elle publie Lebensborn dans lequel elle revient sur l'histoire de sa mère, Katherine Maroger, née dans un lebensborn. Cette dernière en faisait elle-même le récit dans son livre Les Racines du silence paru en 2008 aux éditions Anne Carrière. Avec cet album, Isabelle Maroger est lauréate du prix BD des Rendez-vous de l'histoire 2024.